او پس از جدایی از پرسپولیس،در سال ۱۳۹۱، در تیمی فعالیت نکرد تا سرخپوشان تهرانی آخرین تیمی باشد که مرد پرتغالی در آن مربیگری کرده است.

اعلام بازنشستگی ژوزه در حالی اتفاق می افتد که وی در ۵ سال گذشته پرونده جنجالی شکایت علیه پرسپولیس را در فیفا پیش برده و در همه این مدت خبرهای نگران کننده مختلفی به گوش هواداران تیم سابق او رسیده است تا این مربی به چهره منفوری در نزد هواداران پرسپولیس بدل شود. ژوزه سابقه بازی در بنیفکا و مربیگری در اسپورتینگ، براگا، بنفیکا، تیم ملی فوتبال آنگولا، الاهلی مصر و الاتحاد عربستان را دارد.